一生之中甚为推崇刘元素和吴又可的学术见解。他在自序中云：“一日读《温疫论》，至伤寒得天地之常气，温病得天地之杂气，而心目为之一开。至伤寒自气分而传入血分，温病由血分而发出气分，不禁抚卷流连，豁然大悟。”

杨栗山认为：“论杂气伏郁血分，为温病所从出之源，变证之总。”“千古疑案，两言决矣。”由此他将伤寒与温病进行了因证脉治的详细分析，结合自己丰富的实践经验，著成《伤寒疫条辨》一书。杨栗山认为：“温病之所由来，是因杂气由口鼻入三焦，怫郁内炽。”又指出：“温病得于天地之杂气，怫热在里，由里而达外内之郁热为重。”这里所指温病乃伏气温病而言。由于伏气温病初起即见里热较重的见证，故一旦气机闭塞不通，邪不能达表，则会呈现里热内郁之象。

杨栗山认为：郁热证不仅新感温病有之，更是伏气温病的一个重要形成因素。故治疗上，其提出：若用辛温解表，是为抱薪投火，轻者必重，重者必死。惟用辛凉苦寒，如升降、双解之剂，以开导其里热，里热除而表证自解。据此他创立了以升降散为代表的治疗温病十五方。